manbet手机版采访记录

manbet手机版斯图尔Forsén:三天前，有一项重大宣布，科学界的重大事件，你可以说，美国和英国的团体联合宣布，我想说，整个人类基因组的高质量DNA序列，这一事件的重要性被两位国家元首比尔·克林顿和托尼·布莱尔参加新闻发布会的事实所强调。manbet手机版我们很高兴在这里有两位诺贝尔生理学或医学奖得主，理查德·罗伯茨教授或博士和汉密尔顿·史密斯，他们在人类基因组计划中发挥了不同的作用。manbet手机版事实上，在这次新闻发布会上，你们中有一个人就在白宫。manbet手机版你愿意从这里开始吗?

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:我其实是赛莱拉基因公司的一名员工，这家公司位于马里兰州的罗克维尔，一直在独自决定人类基因组序列，许多人称之为与世界其他地方的竞赛，在美国、英国、德国、日本以及其他一些国家的公众努力下进行。manbet手机版白宫的仪式是试图在公共努力和私人努力之间进行合作，不是合作，而是合作，我们同意不说对方的方法、数据或个性的坏话，我们将尝试在科学杂志上联合发表文章，在2000年年底的某个时候。manbet手机版不是两组共同撰写的论文，而是我们各自发表的论文，在那里我们展示了我们的成就。manbet手机版我认为这样做是一件非常好的事情，它将媒体报道的焦点从交战各方转移到真正重要的事情上，即获得序列并将其公之于众。

manbet手机版在仪式上，克林顿总统做了4-5分钟的简短讲话，然后，通过英国的电视连接，托尼·布莱尔上台，以他最好的演讲风格说了几句话，然后克林顿总统简要介绍了弗朗西斯·柯林斯，他是美国公共努力的负责人，当然，关于能源部的努力有很多话，到处都是好话。manbet手机版那是一场非常精彩的表演，克雷格·文特尔是最后一位演讲者。manbet手机版我想知道当他走到麦克风前，是否还有什么要说的，但克雷格，我认为，处理这种情况非常好，让塞莱拉如何融入这一成就。manbet手机版之后我们举行了新闻发布会。manbet手机版我认为这不仅是公共和私人努力之间的休战，而且还宣布每个团体都实现了他们的目标。manbet手机版公开的人类基因组计划宣布他们已经完成了基因组的工作草案，它代表了基因组的90%的覆盖率，但没有完整的基因组组装，Celera宣布他们已经有了基因组的99%的随机覆盖率，这些序列的组装，所以基因沿着染色体线性排列。

manbet手机版尼尔斯·林格茨:现在我们有两个独立的小组，他们已经就人类基因组的总体结构达成了一致，也许你可以回答这个问题，人类基因组中有多少个基因。manbet手机版这是你们在这个领域演讲时遇到的问题我听过很多不同的数字如果你们遇到这个问题，你们会怎么回答?

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:我认为目前我们仍有相当大的疑问，但在Celera，我们也在对小鼠基因组进行测序，这将在今年年底前完成，我们可以将小鼠序列与人类序列进行比较。manbet手机版老鼠和人类的蛋白质编码区域非常相似，它们可以对齐，然而所谓的垃圾DNA, 97%的基因组不编码…

manbet手机版理查德·罗伯茨:你是在说我发现的这些东西，是吗?

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:是的，差不多。

manbet手机版理查德·罗伯茨:垃圾。

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:是的，垃圾货。

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:……更不相似，所以应该可以简单地在六帧中读取两个基因组，并有很大可能重叠蛋白质编码区域，并得到相当精确的基因数量，这是我们真正追求的策略。manbet手机版我们有鼠标序列，或者我们将会有鼠标序列我们是世界上唯一拥有它的人，所以我认为Celera会有最准确的注释。

manbet手机版尼尔斯·林格茨:因为人们在这个数字上下注，从赌博的角度和我们所接受的以人为本的观点来看，这个问题需要一个权威的答案。manbet手机版为了推动这些大型项目，比如人类基因组计划，显然已经有了先兆，人们从物理学得到了消息现在它们是巨大的项目，大的物理学现在有了大的生物学，那么一旦人类基因组计划完成，我们将如何继续?manbet手机版我想我们都同意，现在最重要的事情是找出基因组的功能，我们现在进入了一种研究，我们想研究最终的产物，蛋白质。manbet手机版因为有很多方法可以处理DNA和基因组的信息，在RNA水平上，有更多的蛋白质有待发现。manbet手机版这个研究生物系统中产生的蛋白质的领域被称为蛋白质组学，那么你看到任何这样的大型蛋白质组学出现了吗?在技术方面可以做些什么来加快对数量比基因多得多的蛋白质的分析呢?

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:我的意思是，我可以说很多我们在赛莱拉的计划。manbet手机版我认为赛莱拉的独特之处在于它能够进行大规模的调查。manbet手机版我们不喜欢做任何事情，除非我们一天能做10万件，不管是什么，这是克雷格·文特尔的想法，它让我们做一些在大学环境或大多数其他公司无法轻易完成的事情。manbet手机版当然，我们的计划是使用PE生物系统公司的新仪器进入蛋白质组学领域，质谱仪每天可以分析数万个蛋白质样本。manbet手机版这个计划最初最大的兴趣是观察特定组织中产生的蛋白质的光谱，正常或病变组织，癌症，等等。manbet手机版该计划是将这些蛋白质从二维凝胶上的癌症组织中分离出来，然后凝胶上的每一个蛋白质点都将在质谱仪中进行分析。manbet手机版本质上是用激光击中蛋白质片段然后与基因组序列进行匹配，再通过计算机，就能预测出人类基因组中每个基因的蛋白质肽谱。manbet手机版假设有5万个，这样我们就可以即时识别出每个点的特定基因产物我们就可以说，一个特定的组织表达了特定的基因我们就形成了一个这种信息的数据库然后再把它卖给我们的订阅者。manbet手机版这是第一步，我们可以很容易地看到，我们可以生产出这个。manbet手机版我不知道我们还能做什么但也许里奇可以。

manbet手机版理查德·罗伯茨:蛋白质组学的真正问题是，你需要将功能与基因联系起来的很多技术目前还不到位，所以一个问题是，如果我们观察特定的组织，如果我们观察大脑，如果我们观察皮肤，如果我们观察肝脏，什么类型的蛋白质正在发生表达，表达了多少?manbet手机版目前我们能够看到信使RNA发生了什么，但我们也从其他实验中知道蛋白质的数量经常与RNA的水平不匹配，所以我们需要既能看到RNA又能看到蛋白质。manbet手机版观察蛋白质的一种方法是使用哈姆刚才谈到的那种技术。

manbet手机版Nils Ringertz:你在这次会议的一个环节中提出了一个观点，那就是一旦你研究微生物基因组，就会有一个叫做最小基因组计划的项目，它试图定义最小基因的数量。manbet手机版这样的系统不是最适合找出各种基因的功能吗?因为人类有这么大的基因组和许多基因，是令人难以置信的复杂。

manbet手机版理查德·罗伯茨:是的。manbet手机版我认为有两个独立的问题，一个问题涉及到什么是真正的生命，你需要什么，你需要的最小指令集是什么你需要一个活细胞?manbet手机版其中一种方法是取我们所知道的最小的自由存活的细胞，就像Clyde Hutchison所做的那样，试着去除那些看起来不需要的基因，直到最小的一组，完全理解它。manbet手机版那么人们至少会知道维持生命所需的最少的东西是什么，但很可能少于500个基因，而这500个基因只是存在于人类细胞中的一小部分。manbet手机版所以，我认为从最小基因组计划中得到的将是一个关于什么是最小生命的工作定义但生命的意义远不止于此。manbet手机版我们需要知道每个基因产物的确切生化功能是什么，它催化了什么反应?manbet手机版这对大多数蛋白质来说是不容易做到的，我们目前正在研究一堆蛋白质，它们存在于迄今为止已经测序过的每种生物中。

manbet手机版我们认为这种特殊的蛋白质将甲基从s -腺苷蛋氨酸转移到别的东西上，但我们不知道是什么，而且不容易发现，也不容易证明。manbet手机版但这是一种有趣的蛋白质，它存在于每个基因组中但我们不知道它的作用，还没有人通过遗传学或生物化学偶然发现它，知道它的作用，有很多这样的蛋白质。manbet手机版在人类基因组中，将会有成千上万种这样的蛋白质，我们需要为它们定义功能，所以我们需要的是找到高通量的方法，快速的方法，我们可以得到功能的线索。manbet手机版高吞吐量的方法之一是通过计算来做,所以你看的蛋白质序列,你试图找到其他蛋白质的蛋白质序列图案我们知道与ATP或他们与DNA或RNA结合蛋白等等,这可以给你一个线索,但你需要做生物化学之后显示的线索是正确的或不,我们没有好的方法来这样做。

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:另一种研究最小基因组的方法是合成方法，我认为这很有趣，在实验室里创造“生命”。manbet手机版我们的想法是生殖支原体是基本的工具或部分。manbet手机版从其他研究中得到一些关于哪些基因是必要基因的想法，人们实际上可以制造一个合成染色体，其中包含一组已经被确定为必要的蛋白质，然后把这个合成染色体放入一个去除天然染色体的细胞中，然后看看你是否能得到一些在实验室中生长的东西。manbet手机版当然，第一次可能不会成功，也许100次也不会成功^{manbet手机版th}manbet手机版也可能是在克隆多莉的某个地方，一开始你必须做数百个，然后才能成功尝试。manbet手机版但如果有人能创造出新的基因组，那将是一件了不起的事情。

manbet手机版理查德·罗伯茨:我想，当你开始思考微生物研究的真正重要性时，在人类基因组的背景下，需要发展一种方法来理解像生殖支原体这样简单的东西是如何工作的，这种方法可以应用于人类基因组。manbet手机版因此，如果我们能学会正确地做这件事，如果我们能学会用一种快速的方式来做小细菌基因组，原则上一切都很容易，我们应该能够将这种方法应用到这些更复杂的系统中，当然，与此同时，我们会发现为了创造生命，什么是真正重要的。manbet手机版是什么让这些蛋白质和基因真的有生命而不仅仅是试管里的一堆化学物质呢?

manbet手机版斯图尔Forsén:如果我们看看人类基因组DNA序列在生物医学上的好处，我敢肯定manbet手机版吉姆·沃森manbet手机版去了国会，他有很多关于好处的想法，并试图说服国会，我还注意到比尔·克林顿提到了癌症，癌症的治疗将是在测序之后的事情。manbet手机版你如何看待人类基因组序列知识在生物医学领域的直接影响?

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:我不认为我能预见到所有的好处或后果，我们将不得不逐步进行，但我似乎很清楚，它将促进正在进行的大部分工作。manbet手机版在过去的几年里，人们做了大量的工作来寻找基因组中的基因并对它们进行亚克隆等等。manbet手机版这应该会使所有这些都短路，我的意思是你应该能够在很多情况下在基因组中找到一个基因或几个基因的复制，然后从这种跳跃开始。manbet手机版我认为一个例子是，有几组蛋白质已经证明了治疗的好处，例如干扰素，我们已经有了一个例子，通过对一种新的干扰素的基因组测序，这是以前没有检测到的。manbet手机版通过整个基因组，你可以经常发现你不知道的蛋白质组的成员，所以这些是新的潜在产物。manbet手机版我们也可以发现新的epogen类型的蛋白质，或者可以刺激特定组织的生长因子，仅仅是通过与已知的生长因子进行类比。

manbet手机版奈尔斯·林格兹:在短时间内测序个体基因组是否可能，短到在医疗实践中很重要，在设计针对某种疾病的治疗方案时很重要?

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:以目前的技术，它太贵了。manbet手机版最终，我认为我们将需要某种物理方法来进行单分子测序。manbet手机版一旦实现，我们可能就能研究整个个体，但目前的一大努力领域是使用各种基因阵列进行大规模基因分型。manbet手机版我的梦想是能够从一个人身上提取一滴血在几个小时内，确定这个人身上的10万个单核苷酸多态性突变，我不应该说突变，而是那个人基因组中的差异。manbet手机版换句话说，为一个人建立一个即时的基因特征，可以用来判断对这个人来说什么治疗是最好的，或者这个人在生活中可能会遇到什么遗传疾病。manbet手机版我认为这可能会在不久的将来实现。

manbet手机版理查德·罗伯茨:我猜你在这里想要表达的真正的观点是人们想要对个体进行研究，了解他们的基因组成。manbet手机版其中一种方法是得到完整的DNA序列，但事实上你可以得到很多信息而不需要看完整的DNA序列，因为这些被称为单核苷酸多态性的东西，我们知道大约每300个碱基，在人类基因组中，有一个区域是不同的，这在每个个体之间是很常见的。manbet手机版通过观察这些区域，本质上只是对基因组的1 / 300进行采样，而不是观察整个基因组，人们实际上可以了解很多关于不同人的遗传倾向。

manbet手机版例如，我们知道有些基因如果出了问题，如果它们有某种特殊的多态性，它们有一个与另一个相反的序列，这就会导致问题，这方面的第一个经典例子是镰状细胞血红蛋白，我们知道血红蛋白DNA序列中的一个碱基改变会使血红蛋白不那么有效。manbet手机版这是一种突变在非洲的人类种群中被很好地保存下来因为当你有这种情况的杂合时，当你有一个镰状细胞基因和一个正常基因时，你就有了对疟疾的抵抗力，如果你生活在非洲，这是非常重要的。manbet手机版这在人群中一直保持着，即使这种选择不再适用于从非洲搬到美国或英国或西欧的黑人他们保持这种突变是因为进化是缓慢的，需要很长时间才能摆脱，有很多疾病都是这样的。

manbet手机版Sture Forsén:你提到了发现SNP /- - - -/的可能性，即对人体进行测序的人类基因组，比如单个组和球形组是不同的，如果你将彼此的序列进行比较，你现在是否已经看到了SNP的证据?

manbet手机版理查德·罗伯茨:是的。

manbet手机版Sture Forsén:我想，它们不应该完全相同。

manbet手机版理查德·罗伯茨:不，到目前为止所发生的基本上是来自Celera的主要序列来自于一个人。manbet手机版还有其他个体正在Celera进行测序，其水平足以识别单核苷酸多态性。manbet手机版公共人类基因组计划，他们已经对很多个体进行了测序，比Celera所处理的数量要多得多所以在他们的数据中已经有了明显的单核苷酸多态性事实上有一个叫做SNIP联盟的组织是一组专门寻找单核苷酸多态性的实验室。manbet手机版这些都是由政府机构和商业公司资助的这些数据都被放在公共领域，所以答案是我们已经知道了很多片段但我们还没有足够的知识来对某人进行完整的基因分型。

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:我们也不知道这些片段中哪些是真正与临床相关的，我的意思是，它们中的很大一部分可能是相当中性的变化。manbet手机版我们不知道有多少在医学上或基因上具有重要意义。

manbet手机版理查德·罗伯茨:但这是人类基因组计划的下一阶段将会出现的结果，即人们试图分配功能并识别基因，因为我们知道其中许多基因对这种疾病或那种疾病很重要，我们可能会找到其中一些基因的同源体，但我们不知道它们是否重要，所以需要进行测试。manbet手机版在很多方面，我们真的处在人类基因组计划的开始，而不是结束，所以即使我们已经宣布我们已经通过了第一阶段，它很大程度上只是一个开始。manbet手机版在过去的几年里，生物学经历了一场革命，它从一门观察科学，人们一直在观察现象，试图理解它们，试图弄清楚发生了什么，变成了一门像化学或物理一样的硬科学，我们现在可以真正看到一个完整的基因组，并对问题做出一些限制。manbet手机版如果我们想要解释一个小细菌是如何工作的，我们可以说我们已经发现了4000或5000个基因，我们需要从这5000个基因的角度来解释这个有机体，如果我们要做一个基因实验，改变其中一个基因，我们知道要寻找什么，我们知道我们必须观察所有其他基因发生了什么，才能开始理解。manbet手机版我认为我们正处于生物学的起步阶段，这对我们来说是一个非常激动人心的时刻，我的意思是，这是一个我想再次成为研究生的时刻，这是一个研究生的时刻，因为有很多发现要做，更多的诺贝尔奖将从这个领域诞生。

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:在科学中，人们倾向于从简单到复杂，然后希望再回到简单。manbet手机版我们现在处于复杂阶段。

manbet手机版Nils Ringertz:但是现在，如果你是一名研究生，正在寻找在生物学领域的职业生涯，你看到这些大型企业在做所有的测序，所以所有的测序都是可用的，你不能从测序中获得博士学位。

manbet手机版理查德·罗伯茨:我们希望不会。

manbet手机版尼尔斯·林格茨:所以你的导师可能买了一个许可证，以获得特定基因组的详细序列，那么这是否让个别研究生试图定义特定蛋白质或信号系统的作用?

manbet手机版理查德·罗伯茨:这当然是一种可能性。manbet手机版基本上你所拥有的是一本巨大的教科书，只不过不是一本带有图表和清晰标题的教科书，它充满了单词，但我们不知道标题是什么，我们不知道如何在图表中解释这一点与这一点之间的关系。manbet手机版这是研究生开始练习的。

manbet手机版汉密尔顿·史密斯:每个有未知功能的基因都是一个博士学位，如果你能弄清楚的话。

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